Google Analyticsは1日5万件以上の計測を「その他」に分類している

グーグルアナリティクスは1日5万件以上のURL計測はその他になります

本当です。1日5万件以上は「その他」になります。

トラッキング コードのトラブルシューティング – Google Analytics – Google Code

「Google Analytics では毎日、ウェブサイトから送信されてきたすべてのデータと、ページビューで並べ替えられた上位 50,000 ページ上のレポートを収集します。残りのページは、[コンテンツ] レポートの「(その他)」という別のセクションにまとめられます。」と記載されています。

ですので上記エントリーでは、その他のページを詳しく知りたい場合は、「トラフィックの多いすべてのページビューを除外するフィルターを使用」する方法を薦めています。

これがアカウント全体なのかは不明ですが、件数の多いサイトで、もしやと思われる方は、一度確認してみましょう。