カスタム変数は、便利な反面自由度が高く、なかなかイメージが掴みづらいかと。
t32kさんのつぶやきで知ったのですが、お困りの方に良エントリーが。
AB Testing with Google Analytics | rowtheboat
こちらのエントリーでは、A/Bテストでカスタム変数を使っています。
pageTracker._setCustomVar(1, "shelf_view", "USERS_AB_NUMER", 1);
※ga.js用
トラッキングコード内にABテスト番号を入れる、というものです。
カスタム変数は本当に使い出のある機能ですね。